The MRH supports research across a wide spectrum of microbiome-related topics, all aimed to of devise methods for improving human and animal health by manipulating microbial populations. One of the main aims of the MRH is to provide an open research and knowledge platform for microbiome interested investigators, so as to foster interdisciplinary interactions. The MRH translates new knowledge on human and animal microbiomes in different research areas and provides a research & technology resource which will allow scientists and industries to investigate the microbiome with potential to change the face and future of healthcare.
The MRH aims to deliver innovative research that establishes Italy as a center of excellence in human/animal health, to help the development of industry and to attract multinational companies to Italy to engage in collaborative research programs.
Parma Microbiota
progetto in corso
Profiling del microbiota fecale per lo screening preventivo di Inflammatory Bowel Diseases (IBD) nella provincia di Parma.
3.
Risultati Attesi
Obiettivo del progetto è la realizzazione di un profilo del microbiota fecale di un campione della popolazione parmense, che costituirà la base per uno screening preventivo delle malattie infiammatorie dell'intestino (IBD).
I dati sulla composizione batterica intestinale, insieme alle informazioni sulla dieta e la salute di 1.000 residenti a Parma, tra cui almeno 100 individui con IBD, costituiranno il database "Parma Microbiota". Questo database sarà utilizzato per valutare i marcatori batterici di IBD escludendo l'effetto dei fattori statistici confondenti (salute fisica e psicologica, terapie in corso, presenza di animali domestici nella famiglia, e assunzione nutrizionale).
Al termine del progetto, l'integrazione statistica della base di dati consentirà uno screening calibrato di tutta la popolazione parmense. I principali vantaggi di una banca dati locale sono: i) prestazioni di screening ottimizzate attraverso la valutazione del l'impatto della dieta locale; ii) inclusione nella banca dati di casi relativi a vari disturbi e malattie non IBD; fornendo così una base per la futura selezione all'interno dell'area geografica specificata.
2.
Il Progetto Parma Microbiota
Il progetto mira a monitorare i marcatori microbici intestinali della IBD nella popolazione di Parma analizzando il microbiota fecale di un gruppo iniziale di 1.000 soggetti, compresi almeno 100 individui affetti da IBD. L'obiettivo è sviluppare e convalidare una procedura di routine per la diagnosi precoce, non invasiva e facilmente applicabile della IBD. Inoltre, il progetto creerà la base di dati "Parma Microbiota", che comprenderà, per ciascun individuo, dati su: i) composizione del microbiota intestinale; ii) informazioni sul l'assunzione alimentare e nutrizionale; iii) parametri clinici sanitari e informazioni su eventuali disturbi o malattie in corso.
La base di dati sarà costituita da dati anonimi raccolti con il consenso del partecipante e sarà resa disponibile attraverso un portale web, con statistiche aggiornate mensilmente. La caratterizzazione dell'impatto della dieta locale sulla definizione della composizione batterica intestinale consentirà quindi di ottimizzare l'uso di marcatori microbici specifici di IBD per lo screening preventivo nel comune di Parma.
Output
- Iscrizione di 1.000 individui rappresentativi della popolazione del territorio parmense.
- Raccolta di un campione fecale, che sarà utilizzato per determinare la composizione del microbiota intestinale attraverso un approccio metagenomico noto come 16S rRNA gene profiling.
- Completamento supervisionato del questionario dietetico EPIC per la valutazione dell'assunzione alimentare abituale attraverso uno strumento convalidato.
- Esame medico della persona iscritta, anamnesi clinica e compilazione di un questionario medico.
- Compilazione supervisionata di questionari e raccolta non invasiva di indicatori neurovegetativi e neuroendocrini dello stress cronico e/o delle comorbidità psicologiche.
- Integrazione dei dati raccolti in un database on-li ne accessibile gratuitamente, con aggiornamenti statistici mensili.
- Integrazione statistica dei dati e ottimizzazione delle soglie di abbondanza dei marker microbici per lo screening preventivo della IBD nel comune di Parma.
- Identificazione di individui a rischio o attualmente colpiti da IBD nell'area di Parma.
Risultato
Il "Microbiota di Parma" base di dati servirà da prototipo a livello nazionale ed europeo per introdurre nuove metodologie metagenomiche nella pratica clinica preventiva locale e fornirà una solida base per uno screening completo della popolazione di Parma volto al l'identificazione precoce delle IBD. La creazione di una banca dati che integri dati microbiologici, nutrizionali e clinici di 1.000 individui all'interno di un'area geografica definita (il comune di Parma) è un punto di partenza necessario per consentire l'uso efficace e ottimale dei marcatori microbici per le IBD (e successivamente, per altri disturbi e malattie), tenendo in debito conto fattori geografici specifici, quali la dieta.
1.
Introduzione
È ampiamente noto (oltre 1000 pubblicazioni in PubMed) che i cambiamenti nella composizione del microbiota intestinale (come le alterazioni nella relativa abbondanza di microrganismi come *Faecalibacterium*, *Alistipes* e *Fusobacterium*) sono stati associati a malattie infiammatorie dell'intestino (IBD), come la malattia di Crohn e la colite ulcerosa, la cui prevalenza è in forte aumento (oltre 200.000 casi in Italia, secondo l'AUSL).
L'identificazione di questi marcatori microbici, considerati sempre più importanti per la diagnosi precoce della IBD, può ora essere ottenuta profilando le comunità batteriche nei campioni fecali (microbiota fecale) utilizzando approcci molecolari innovativi noti come metagenomica.
Tuttavia, i dati di profilazione attualmente disponibili non tengono conto di fattori importanti come la dieta, la convivenza con animali domestici e la co-occorrenza di stress cronico o condizioni di salute mentale come l'ansia e la depressione. Questi fattori dovrebbero essere considerati per evitare effetti statistici di confusione, che sono già stati evidenziati nella letteratura. Inoltre, vi è una mancanza di dati di profilamento geograficamente localizzati che potrebbero consentire l'identificazione di nuovi e specifici marcatori microbici.
4.
Results
Alla fine della prima fase del progetto Parma Microbiota, i dati raccolti sono stati analizzati approfonditamente.
Di conseguenza, sono stati pubblicati due articoli scientifici nei quali i risultati vengono presentati e discussi in dettaglio.
